Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Piezo1E2JF22 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Piezo1E2JF22 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Piezo1E2JF22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Piezo1E2JF22 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182 ms