Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cngb1E1AZ71 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cngb1E1AZ71 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cngb1E1AZ71 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cngb1E1AZ71 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
Cngb1E1AZ71 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cngb1E1AZ71 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cngb1E1AZ71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms