Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ38

Gm45062, Predicted gene 45062, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45062E0CZ38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm45062E0CZ38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm45062E0CZ38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms