Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl3E0CZ16 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl3E0CZ16 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms