Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms