Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd1D3YXK1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd1D3YXK1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd1D3YXK1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms