Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BC048679D3YXE9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC048679D3YXE9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC048679D3YXE9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms