Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm4297D3YWB7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4297D3YWB7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms