Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim30cD3YVI9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms