Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nlrc5C3VPR6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrc5C3VPR6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms