Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kpna7C0LLJ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kpna7C0LLJ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms