Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Clip3B9EHT4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Clip3B9EHT4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clip3B9EHT4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms