Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11cB4XVP9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms