Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pnldc1B2RXZ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms