Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Polr3aB2RXC6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr3aB2RXC6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr3aB2RXC6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms