Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clrn2B2RVW2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clrn2B2RVW2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clrn2B2RVW2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms