Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Abcc8B2RUS7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
Abcc8B2RUS7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Abcc8B2RUS7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Abcc8B2RUS7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms