Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AU015836B2RUM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AU015836B2RUM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms