Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
AU022751B1B0V2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
AU022751B1B0V2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AU022751B1B0V2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AU022751B1B0V2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms