Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr2B1AVP0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Phactr2B1AVP0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phactr2B1AVP0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms