Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d2B1AVH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d2B1AVH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbc1d2B1AVH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms