Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scml2B1AVB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Scml2B1AVB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms