Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spocd1B1ASB6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spocd1B1ASB6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spocd1B1ASB6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spocd1B1ASB6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms