Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al2bA9Z055 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.3 ms