Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2c2A7L9Z8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2c2A7L9Z8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2c2A7L9Z8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2c2A7L9Z8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms