Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r232A2RTT5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r232A2RTT5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms