Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf39A2RT81 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf39A2RT81 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf39A2RT81 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf39A2RT81 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf39A2RT81 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms