Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al1jA2BFR3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1jA2BFR3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms