Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samt1A2BED8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms