Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtf1A2AQ19 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtf1A2AQ19 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtf1A2AQ19 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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