Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn1aA2APX8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn1aA2APX8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scn1aA2APX8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms