Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Cavin4A2AMM0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cavin4A2AMM0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cavin4A2AMM0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin4A2AMM0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms