Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FocadA2AKG8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FocadA2AKG8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FocadA2AKG8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.8 ms