Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnksr1A2A9K7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnksr1A2A9K7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnksr1A2A9K7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnksr1A2A9K7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnksr1A2A9K7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms