Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisal2aA2A9G7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal2aA2A9G7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms