Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prdm16A2A935 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prdm16A2A935 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Prdm16A2A935 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Prdm16A2A935 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Prdm16A2A935 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Prdm16A2A935 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Prdm16A2A935 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Prdm16A2A935 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
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