Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbf1A2A870 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbf1A2A870 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbf1A2A870 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms