Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc1lA2A5N3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc1lA2A5N3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc1lA2A5N3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pabpc1lA2A5N3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc1lA2A5N3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc1lA2A5N3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms