Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28360A0A087WR25 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28360A0A087WR25 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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