Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28919A0A087WP35 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
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Gm28919A0A087WP35 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Gm28919A0A087WP35 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Gm28919A0A087WP35 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Gm28919A0A087WP35 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Gm28919A0A087WP35 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28919A0A087WP35 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28919A0A087WP35 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Gm28919A0A087WP35 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
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