Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trav14-2A0A075B694 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav14-2A0A075B694 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trav14-2A0A075B694 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trav14-2A0A075B694 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trav14-2A0A075B694 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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