Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trbv31A0A075B5J5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv31A0A075B5J5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Trbv31A0A075B5J5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Trbv31A0A075B5J5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Trbv31A0A075B5J5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv31A0A075B5J5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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