Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Robo3Q9Z2I4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms