Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn8Q9Z260 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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