Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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RfxankQ9Z205 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RfxankQ9Z205 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms