Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Lgr5Q9Z1P4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Lgr5Q9Z1P4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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