Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Cldn9Q9Z0S7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn9Q9Z0S7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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