Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Cldn13Q9Z0S4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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Cldn13Q9Z0S4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Cldn13Q9Z0S4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn13Q9Z0S4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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