Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Plod1Q9R0E2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms