Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf25Q9QZR0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf25Q9QZR0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms